PoSeNoGap

REDS, HEIG-VD

Thoma Yann

12.12.2016 - Fond Suisse

Portable Scalable Concurrency for Genomic Data Processing

PoSeNoGap vise à développer un nouveau framework pour traitement des données génomiques. A l'heure actuelle le séquençage s'un génome humain génère environ 300GB de données brutes. Dès lors il est indispensable de pouvoir les compresser, et l'analyse de ces données est très coûteuse en temps de traitement. Durant les trois ans de PoSeNoGap, de nouvelles méthodes de compression sont en cours de développement. Dans ce contexte, l'institut REDS développe une solution performante pour le clustering de séquences non mappées grâce à une plateforme FPGA de PicoComputing.

 

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